Deine Festplatte wird formatiert, wenn diese in eine andere PS4 eingebaut wird. Sichere deine Speicherstände vorher in den Onlinespeicher oder mach ein Backup. Die Festplatte wird dann beim Rückbau in deine eigene PS4 nochmals formatiert. Ich bin mir aber nicht sicher wie das mit der Firmware ist. Ob die draufbleibt oder nicht weiß ich nicht. Wenn ganz normal formatiert wird, dann eher nicht.
Was ich dir ebenfalls empfehle. Trenne alle USB Geräte von deiner PS4 bevor das update installiert wird. Ich hatte beim Update auf Version 9.00 probleme und es lag am Astro A50 Headset, welcher am USB Port war.